Istoria lui Palo Santo datează din civilizațiile precolumbiene. Incașii foloseau lemnul sacru în ritualurile lor religioase pentru a aduce un omagiu zeilor lor. În prezent, este folosit în Anzii din Peru de către șamani în cadrul ceremoniilor de Ayahuasca, servind o infuzie de Palo Santo participanților pentru a-și purifica corpul și spiritul.