Die Geschichte des Palo Santo geht auf präkolumbianische Zivilisationen zurück. Die Inkas verwendeten heiliges Holz in ihren religiösen Ritualen, um ihren Göttern zu huldigen. Derzeit wird es in den peruanischen Anden von Schamanen bei Ayahuasca-Zeremonien verwendet, die den Teilnehmern einen Aufguss aus Palo Santo servieren, damit sie ihren Körper und Geist reinigen können.